在处理完黑暗市的事情后，小智等人又路过了一处游乐场，原本小智想要直接前往大傻谷的，但经不住小霞一个劲的央求自己，最后，小智也无奈陪她在这里玩了一圈。
期间小智还偷偷去狠揍了一顿，上辈子利用过自己的魔术师，顺便还一脚踩爆了他蛋蛋的神奇宝贝球，免得他再利用蛋蛋的催眠术出去祸害其他人。
然后他们玩完之后，又旅行到了胖丁在的不夜城，这次，小智没有丝毫停留，立即带着小刚小霞逃也似的离开了这里，他可知道那个粉色恶魔这次遇上，会一直跟到自己无印篇结束，自己可不想总是被它在脸上到处乱画！
最后，经过连日的赶路，小智等人终于如愿到达了大傻谷附近。
其实每当听见这个名字的时候，小智都会忍不住在心里吐槽
大傻谷，这个名字取得还能再草率一点吗！
“哟~小智！又遇见了！”
“小茂！”众人齐声惊呼！
“皮卡！(?*?*?)”皮卡丘还是一如既往跟小茂表达了亲近。
“小茂，你过来应该也是为了化石吧！”对于小茂，小智没有隐藏的必要，直接开门见山的跟他说道。
“是啊！小智，你也是吗？”小茂也丝毫不意外。
“既然这样，小茂你待会先让你的那群…女朋友离开一下，你跟我们一起行动吧！”
“哦？小智！难道你又有什么消息了？”小茂顿时来了兴趣。
“嘿嘿！这你不要管，总之，绝对会让你满载而归的！”小智自信的说道。
“行！全听你的！”小茂也是对小智的话深信不疑。
随后，众人也一起往大傻谷深处走去。
……
等到众人来到一处人烟稀少的地方，众人发现火箭队那三个怨种正在计划着炸了这里，这让小茂小刚还有小霞都感到怒不可遏！
而小智则是表示淡定
“行了！诸位，你们还真别说，这回他们还真做对了！”
“小智，你这是什么意思？”小霞不解道。
“你们先别管了，我来跟他们交涉一下。”
“喂！火箭队！有没有兴趣合作一下啊！”
“哼！小鬼头！你又想耍什么把戏！”
“没有，这回是真心找你们合作的，如果合作愉快的话，最后，我可以送你们一只化石盔或者菊石兽怎么样？”
“什么？小智！你哪有这两只神奇宝贝啊！”小刚也是不解的大叫。
“现在没有，待会不就有了吗！”小智也是自信地说道。
“难道，这里有古代神奇宝贝的存在吗？”火箭队也是喃喃道，随后，他们立即大笑起来
“哈哈哈！既然如此，多谢你了，小鬼头！”
“谢谢你提供这些情报了，这里的古代神奇宝贝们我们就全部接收了！”
“我们全都要！喵！”
“这么贪心，可不太好啊！”
“况且就算给你们那么多只，你们也养不起吧！”小智善意的提醒道。
“哼！我不管！反正我就是全都要！”武藏任性的说道。
“既然这样，那你们就别怪我了！”
“皮卡丘！送他们退场吧！”
“皮卡丘！”随后皮卡丘一发十万伏特，直接让火箭队提前退场。
“就该答应他的！”
“都怪武藏太任性了！喵！”
“哼！你们刚刚不是也没拦着吗？现在全怪我一个了！”
“好讨厌的感觉啊！”
就这样，火箭队在一片打闹声中，提前退场了……
…………
随后小智带着众人来到了山下，在远处见到了火箭队埋藏的火药，随后小智认真的跟众人说道
“大家注意，待会，我来引爆这些炸弹，给地面开个大洞，这下面有个地底洞窟，这里面有好几只古代神奇宝贝，我们下去后，把它们抓了就走，不要让任何人知道。”
“明白！”
“既然这样，去吧！电击兽！妙蛙草！”
“小茂！你有没有学会守住的神奇宝贝，有的话，赶紧放出来！小霞，你也赶快将宝石海星放出保护自己！”小智立刻提醒道。
“好的，没问题！”两人立刻做出回应。
“出来吧！电击兽！”
“出来吧！宝石海星！”
当所有人都被一只宝可梦守护起来的时候，小智命令皮卡丘对着炸药桶使出了十万伏特！
“轰隆隆！”
随着皮卡丘的攻击抵达后，炸药桶立刻发生了爆炸，霎时间，天崩地裂，日月无光，大地，裂开了！
所有人都在宝可梦的保护下，成功从裂缝中到达了地底世界。
“哇~没想到这里这么大！”小霞率先感叹着。
“你们快看！上面堵起来了！”小刚说完，众人也是往上面望去。
“这个倒是没事，待会直接拿出飞行系神奇宝贝，一个冲锋就破开了，现在最主要的是，我们时间不多了，要赶紧找到古代神奇宝贝们，将它们收服！”
“这里刚刚的爆炸声肯定惊动了其他游客，据我了解，这里神奇宝贝一共就七八只，一旦给人发现我们在这里找到这个地底洞窟，会有无数的人来和我们相互竞争的！”
“说得没错！小智！你有什么办法吗？”小茂立刻上前问道。
“嗯……”小智也是陷入了沉思，根据上辈子的记忆，现在古代神奇宝贝们应该是被自己吵醒了，它们会自动出现，找自己等人复仇，但是，现在一直没出来，估计应该也是由于自己穿越所造成的时间偏移，现在，刚刚制造的动静不够，所以，那些神奇宝贝们应该还在沉睡。
正当小智沉思的时候，看见了一旁的妙蛙草，这时，他终于知道该怎么办了！
“对了！小茂！你身上有带会香甜气味的草系神奇宝贝吗？”
“嗯，我有霸王花！”
“那太好了！你将它放出来，和我的妙蛙草一起释放香甜气味将它们引出来不就行了？”
“好主意！”小茂这时也恍然大悟！平日里他也没少使用这招抓捕神奇宝贝，只不过，和小智待在一起，他习惯将事情都交给小智了，一时间将这件事自己给搞忘了。
“出来吧！霸王花！用香甜气味！”
“花！”
“妙蛙草！你也使用香甜气味！”
“达乃！”
两只神奇宝贝同时使用了技能，搞得现场众人也是一阵陶醉。
“哇奥！”
没过多久，远处传来了阵阵叫声。
等它们走近后，众人才认出来。
菊石兽、化石盔、镰刀盔、多刺菊石兽，每样各两只，肯定是足够大家分了。
“太好了！小智！有这么多的古代神奇宝贝哎！”小霞兴奋道。
“嗯！你们你人挑一只吧，剩余的我最后抓起来，送给大木博士研究吧。”
“可是，小智你不要吗？”小茂也是疑惑地问道。
“我对它们没兴趣，不过，待会还有一只，小茂，你可不许和我抢哦！”
“哦？能让你感兴趣的神奇宝贝，我倒想见识见识，不过，你想让我不跟你抢，总得要给我点好处吧。”小茂冲小智挑挑眉。
“我都带你来抓古代神奇宝贝了，这都还不算好处？”小智也是满头黑线。
“当然了！你身为本少爷的仆人，这点小事是你应该做的。”小茂仍是臭屁地说道。
“好吧，我服你了，我的茂少！”
“以后，我送你一只附和你作战风格的神奇宝贝总行了吧！”小智也只能无奈的服软了。
“呵呵，这还差不多！”随后，小茂也跑过去加入了小刚和小霞激斗中。
这些神奇宝贝，等级都不低，最弱的也有43级，全都迈入精英级别了，甚至说，只要捕捉到手，立马就能投入战斗序列。
小刚选择了一只镰刀盔，小霞选择了一只多刺多刺菊石兽，而小茂则是聪明地抓了只化石盔，跟随小智那么久，他知道有些神奇宝贝进化的早，并不是什么好事，所以，他还是选择一只化石盔，然后再将它培养进化，这样才是最好的培育方式。
因为，这里的精灵等级都不低，所以小刚小霞战得略显吃力，而小茂则展现得游刃有余。
最后，小茂使用霸王花一发超级吸取，打败了化石盔，成功收服了它，随后，他站到小智的身边，等待着小刚小霞的战斗。
经过连番苦战，小刚的大岩蛇找准机会一发铁尾成功击中了镰刀盔，小刚见状也是立刻掏出神奇宝贝球将它收服了起来。
而小霞那边就有点难办了，她放着好好的宝石海星不用，非得要用海星星，搞得现在局势非常严峻，一个不慎，海星星就会失败。
既然这样，小智所幸也先不管她了，他命令电击兽和皮卡丘开始收割剩下的其他宝可梦们。
然后，等小智那边完事之后，小霞终于还是输了…
随后，她也是尴尬地掏出了宝石海星的宝贝球，继续跟对面决一胜负。
最后，宝石海星两发十万伏特，直接结果了对方，这看的小智三个男孩也是阵阵无语。
你早这么打，不就没事了？
非得先送一个，再打输出。
小霞完事后，所有人也是集中到了小智身边
“小智，我们都好了，现在帮你去寻找，你想要的神奇宝贝吧。”小茂率先开口道。
“不急！从刚刚你们的战斗中，我也看出来了，这里的神奇宝贝等级都不低，我想抓的那只神奇宝贝，我估计最少也得50级往上跑，我手上现在50级以上的也就只有皮卡丘和比雕，但属性都被克制，我现在得要先想个战术才行！”
“属性被克制，你又对镰刀盔和化石盔不感兴趣…难道是！”这时，小茂终于反应了过来。
“没错！小茂！”
“你猜对了！”小智会心的一笑。
“可恶！我又上你这个家伙的当了！”小茂有些懊恼。
“你们在打什么哑谜啊？”小霞有些摸不着头脑。
“小霞，你平时基本上都只关注水系神奇宝贝，所以不知道也正常。”小刚这时也反应过来了，就只有小霞还是一脸懵逼。
“呃啊！”就在众人还在讨论的时候，刚刚的战斗已经把那只神奇宝贝引过来了。
一只化石翼龙出现在众人眼前。
小智也是拿出图鉴查看了一下对面的等级，55级，在野生宝可梦里来说，是个相当不错的等级了，但小智此时眉头紧皱着。
这只的素质相当不错，但皮卡丘和比雕对上的话，会相当难打，而其他神奇宝贝等级都差了一些，卡咪龟和妙蛙草虽然属性有利，但它们现在的等级都不高，也就四十多级，唯一一个能等级差不多能赶上它的火恐龙，属性也是被克得死死的。
这就让小智现在很难办！
“呃啊！”没等小智先出手，化石翼龙就先对着小智他们杀了过来。
“去吧！火恐龙！使出合金爪！”危机时刻，小智还是决定使用火恐龙。
虽然，火恐龙等级不如比卡丘和比雕，上辈子也是被对面血虐，最后是靠进化成喷火龙才能追着对方打。
但这回的战斗，既然大家的属性都被克到了，那这个机会还不如给火恐龙雪耻呢。
“砰！”火恐龙一击打飞了化石翼龙，对面的化石翼龙也被这一击打怒了，立刻使出原始之力攻了过来。
“火恐龙！用劈开打碎这些原石！”
“砰！砰！砰！……”
火恐龙的攻击连续不断地打击着化石翼龙的攻击，但它本身也被化石翼龙给牵制住了。
“呃啊！”这时，化石翼龙趁火恐龙一个不注意，使出一发亿万冲击打飞了火恐龙。
“火恐龙！没事吧！”小智立马过去查看了火恐龙的情况。
“吼！”火恐龙强撑着站了起来。
“好！既然这样，继续使出合金爪！”
“吼！”火恐龙又冲了上去，对着化石翼龙展开了攻击，但对面这回学聪明了，直接飞了起来，让火恐龙抓不到它。
“吼吼！”火恐龙在地上气得直跺脚，随后，身体闪烁出进化的光芒！
不好！
小智见状连忙过去按住了火恐龙的脑袋，阻止了它的进化
“火恐龙！不要冲动！现在进化，对你的未来没有好处！”
“吼~”这时，火恐龙听到小智的声音，也再次压制着自己的体内的能量。
过了好一会，火恐龙终于压制住了体内狂暴的能量，随后，小智望着对面一脸不屑的化石翼龙缓缓说道
“小子！看来你很狂啊！”
“是不是自认为会飞了不起？待会我就教教你什么叫真正的战斗！”
“呃~”化石翼龙还是一脸不屑的样子。
“呵呵！既然如此，你就看好吧！”
“火恐龙！使出火焰旋涡！”小智在一旁怒吼道。
“吼！”强大的火焰包裹了化石翼龙，虽然效果不明显，但每回合都会对对面持续造成百分比伤害。
“呃啊！”化石翼龙继续进攻了过来。
“小心！火恐龙！它使出钢翼了！”
“躲开后！使出合金爪！”
“吼！”火恐龙根据小智的命令让过化石翼龙的攻击，然后，合金爪狠狠抓到化石翼龙的背上。
“呃！”化石翼龙惨叫一声，飞了出去。
“不要给它喘息机会！追上去，火恐龙，连续使出合金爪！”
火恐龙闻言也是跳上了化石翼龙的后背，疯狂地对它进行攻击，这一套将化石翼龙打得惨叫连连。
最后，化石翼龙空中一个回旋将火恐龙甩了下来，愤怒地望着小智和火恐龙，而小智则是微微一笑
“小子！你刚刚不是很狂吗？”
“现在呢？我告诉你！火恐龙如果刚刚进化，现在的你就会被按在地上摩擦了！”
“所以，我一直搞不懂，就凭你那点本事，究竟有什么好狂的？”
小智也是在不停刺激着化石翼龙，最后，对方果然中招了，使出亿万冲击，不管不顾地向小智他们冲来。
“火恐龙是赢是输，就看这最后一击了！”
“现在给我冲过去！”
“吼！”火恐龙闻言也是对着化石翼龙冲了过去。
差一点，还差一点！
小智也在心中不停默念。
就在双方快要接近的时候，机会终于到了！
“火恐龙！直接俯身躲过去！对着它的肚子使出合金爪！”
“吼！”火恐龙也是瞅准机会，一招打飞了化石翼龙，这回终于打得对方站不起来了。
“好机会！去吧！宝贝球！”小智也是抓紧机会，一个高级球扔了过去。
最后，在感应灯闪烁三下后，小智成功收服了化石翼龙。
小智也是快步冲过去捡起了高级球，众人见状也都赶了过来向小智恭喜着。
这时，小茂反而有些庆幸，以刚刚这只化石翼龙的能力，就算小智让给自己，以自己现在的水平估计也对付不了，现在，小智将它抓住了，以后他还欠自己一只附和自己风格的神奇宝贝，自己这算是赚大了。
最后，小智使用比雕，对着上方的使用钢翼打了一个出口，然后，众人赶紧趁着别人还没有反应过来的时候，立马跑得远远的。
至于原本这里应该会捡到波克比的蛋，小智压根没有去找，那只波克比，小智根本对它一点好感都没有，根本就是熊孩子一个，还老拖累自己的皮神给它当保姆，这回，小智要从根本上杜绝那只波克比的加入，自己可没那么多时间，让皮神给它当保姆。
那颗蛋就这样扔在那里，爱谁要谁要吧！
而小茂也将刚刚收服的化石盔一起交给小智，让他找个地方帮自己传回去给大木博士先检查一下身体，他要去找他的女朋友们了。
这让一旁的小刚羡慕得眼珠子都快掉出来了。
随后，小智和小霞也是强行拉走了眼巴巴的小刚，找了处传送点，将这些古代的活化石们都送去博士的研究所了，并且，小智还是把比雕、火爆猴、卡咪龟x4一起传了回去，当大木博士得知不仅比雕回来了，还带回了一群古代神奇宝贝，那笑得都合不拢嘴了！